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查询苹果手机删除的短信可以通过以下几种方法。
1、iTunes备份：若您已经使用iTunes备份了手机数据，可以按照以下步骤恢复已删除的短信：
连接手机与电脑，打开iTunes并识别设备。
在设备信息界面点击“恢复备份”。
选择最近的备份文件，点击“恢复”。
完成恢复后，短信应该已经被恢复到了手机上。
此方法会恢复所有备份数据，包括其他非短信数据。
2、专业数据恢复软件：可以使用第三方软件如开心手机恢复大师等，通过扫描手机存储空间来恢复已删除的短信，具体步骤因软件而异，但通常需要连接手机并扫描特定区域以找到已删除的数据，这种方法可能需要付费，且无法保证一定能恢复所有删除的短信。
3、iCloud备份：若您使用iCloud备份手机数据，可以尝试通过以下步骤恢复已删除的短信：
连接手机与Wi-Fi网络。
打开手机设置，点击“通用”，然后选择“还原”。
在还原选项中选择“从iCloud备份恢复”。
输入Apple ID密码并选择最近的备份文件，完成恢复后，短信应该已经被恢复到了手机上，同样地，此方法会恢复所有备份数据。
无论使用哪种方法，都需要在数据被覆盖之前进行恢复操作，如果新的数据已经覆盖了已删除的数据，那么可能无法恢复，使用第三方软件可能存在风险，建议在使用前仔细阅读软件说明并确保其安全性，如果以上方法均无法恢复删除的短信，建议寻求专业技术人员的帮助。